Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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FOXC1Q12948 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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FOXC1Q12948 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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FOXC1Q12948 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
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FOXC1Q12948 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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FOXC1Q12948 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FOXC1Q12948 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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