Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LMAN2Q12907 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LMAN2Q12907 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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