Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TP53BP1Q12888 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TP53BP1Q12888 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms