Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BPTFQ12830 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms