Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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TWF1Q12792 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TWF1Q12792 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TWF1Q12792 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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TWF1Q12792 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TWF1Q12792 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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