Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASGEF1BQ0VAM2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms