Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NCBP1Q09161 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms