Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SCN1BQ07699 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms