Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TFF3Q07654 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms