Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LTBQ06643 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LTBQ06643 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms