Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GBE1Q04446 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms