Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
XPCQ01831 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XPCQ01831 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
XPCQ01831 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XPCQ01831 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms