Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FANCCQ00597 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FANCCQ00597 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.1 ms