Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MAT1AQ00266 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MAT1AQ00266 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms