Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CSNK2A1P68400 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms