Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ARF6P62330 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ARF6P62330 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ARF6P62330 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ARF6P62330 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ARF6P62330 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms