Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UBE2NP61088 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
UBE2NP61088 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms