Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2MP61081 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms