Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LOXL3P58215 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LOXL3P58215 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LOXL3P58215 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LOXL3P58215 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms