Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIRAP54198 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIRAP54198 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms