Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CRISP1P54107 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms