Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EFNA3P52797 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EFNA3P52797 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms