Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNTAP49354 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNTAP49354 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNTAP49354 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms