Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDK8P49336 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDK8P49336 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDK8P49336 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDK8P49336 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms