Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PITPNBP48739 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms