Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ME1P48163 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ME1P48163 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ME1P48163 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ME1P48163 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms