Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GABRB2P47870 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GABRB2P47870 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms