Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

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Length 646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MCAMP43121 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MCAMP43121 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
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