Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPS1P31327 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CPS1P31327 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CPS1P31327 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CPS1P31327 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CPS1P31327 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CPS1P31327 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms