Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C4BPBP20851 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
C4BPBP20851 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms