Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CASTP20810 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASTP20810 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASTP20810 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASTP20810 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASTP20810 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASTP20810 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASTP20810 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASTP20810 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASTP20810 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms