Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB3BP20337 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms