Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDSP20132 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDSP20132 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDSP20132 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SDSP20132 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SDSP20132 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDSP20132 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SDSP20132 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SDSP20132 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SDSP20132 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSP20132 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSP20132 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SDSP20132 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms