Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
XBP1P17861 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
XBP1P17861 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms