Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ITGB4P16144 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGB4P16144 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms