Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CD46P15529 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD46P15529 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD46P15529 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD46P15529 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CD46P15529 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CD46P15529 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CD46P15529 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CD46P15529 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms