Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC5A1P13866 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms