Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COL6A2P12110 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms