Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
VPREB1P12018 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms