Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms