Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CSF1RP07333 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF1RP07333 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms