Protein–RNA interactions for Protein: P01229

LHB, Lutropin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHBP01229 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LHBP01229 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHBP01229 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHBP01229 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHBP01229 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
LHBP01229 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LHBP01229 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LHBP01229 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHBP01229 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms