Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ATG7O95352 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG7O95352 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ATG7O95352 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ATG7O95352 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms