Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms