Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP5O75197 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP5O75197 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP5O75197 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP5O75197 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP5O75197 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP5O75197 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LRP5O75197 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LRP5O75197 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms