Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF5BO60841 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms