Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRAK2O60296 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms