Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CREB3O43889 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CREB3O43889 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms