Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRKAB2O43741 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKAB2O43741 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms