Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KCNQ3O43525 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms